【摘 要】
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根据GenBank中发表的山羊关节炎-脑炎病毒CAEV-CO株的全基因组序列,设计合成了5对引物,对CAEV陕西株的全基因组进行了PCR扩增,并对扩增产物进行了克隆和测序。结果表明,C
【机 构】
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天津大学化工学院,天津,300072
【出 处】
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第二届京津冀畜牧兽医科技创新论坛暨第六届新思想、新方法、新观点“首农杯”论坛
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根据GenBank中发表的山羊关节炎-脑炎病毒CAEV-CO株的全基因组序列,设计合成了5对引物,对CAEV陕西株的全基因组进行了PCR扩增,并对扩增产物进行了克隆和测序。结果表明,CAEV-陕西株基因组全长为9 065nt,GenBank登录号为GU120138,包括两端的长末端重复序列,结构蛋白编码基因gag、pol、env和调节蛋白编码基因tat和rev,以及辅助蛋白编码基因vif,核苷酸序列比对表明,CAEV陕西株和CAEV甘肃株的同源性为99.6％,与CAEV-CO株的同源性为92.4％,对已报道的全基因组序列和gag基因序列分别进行了遗传进化分析,并构建了遗传进化树,结果显示CAEV陕西分离株和甘肃分离株、CAEV-CO株的亲缘关系较近,而与意大利、挪威分离株的关系稍远,同时表明CAEV陕西分离株属于SRLV E2亚型。
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