【摘 要】
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为解决基因组序列无损压缩中的Context稀释问题,提出一种基于Context树模型的无损压缩算法。该算法基于PPM算法构建Context树模型,利用父节点与子节点的编码增益优化Context树;并利用描述长度增量作为优化标准,使Context树模型充分利用树节点的计数分布,估计当前符号的近似概率,最终使用算术编码器实现压缩。实验结果表明,该算法在较小微生物基因组中具有较好的压缩效果。
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为解决基因组序列无损压缩中的Context稀释问题,提出一种基于Context树模型的无损压缩算法。该算法基于PPM算法构建Context树模型,利用父节点与子节点的编码增益优化Context树;并利用描述长度增量作为优化标准,使Context树模型充分利用树节点的计数分布,估计当前符号的近似概率,最终使用算术编码器实现压缩。实验结果表明,该算法在较小微生物基因组中具有较好的压缩效果。
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