哈萨克斯坦努尔卡斯甘斑岩铜-金矿矿区内含矿岩体为卡拉达干杂岩体中的花岗闪长斑岩和侵入其中的石英闪长玢岩、石英闪长岩、少量闪长岩，岩石普遍蚀变较强。矿区内发育浸染状、网脉状和角砾状铜矿化。矿石中金属矿物主要为黄铜矿和磁铁矿，次为黄铁矿，少量斑铜矿、蓝辉铜矿、金红石、赤铁矿、黝铜矿和等。脉石矿物有钾长石、钠长石、绢云母、伊利石、石英、绿泥石、绿帘石、碳酸盐、硬石膏及电气石等。其中，硬石膏丰富，呈浸染状或发育热液脉，暗示成矿母岩浆具富S、高氧化性特征。矿区内热液蚀变强烈，目前识别出的蚀变类型包括阳起石化、钠长石化、钾长石化、黑云母化、绿泥石化、绿帘石化、绢云母，伊利石化、白云母化、硅化、碳酸盐化、电气石化及黄铁矿化等。根据不同蚀变组合，可划分为Ca-Na硅酸盐化、钾硅酸盐化、青磐岩化、中级泥化和绢云母化。