气单胞菌PFGE分子分型方法的建立及其初步应用

来源 :2013年中国水产学会鱼病专业委员会学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhaodhsnd
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  目的:脉冲场凝胶电泳((Pulsed field gel electrophoresis,PFGE)是近年发展起来的细菌分型的方法,由于其具有重复性好、分辨率高、敏感性强等特点,成为细菌亚分型的"金标准"。该法应用于气单胞菌的分子分型,通过观察电泳条带的差异,比较不同来源菌株之间的亲缘关系。方法:本实验通过对2012年9月在广东省4个不同综合养殖场分离采集的不同来源(包括鱼、池塘水、底泥、猪粪)的57株气单胞菌,提取其基因组DNA,用限制性内切酶XbaI消化后进行脉冲场凝胶电泳分型,所得结果通过Image Lab及SPSS系统聚类进行分析。结果:除5株电泳条带降解外,52株气单胞菌的基因组DNA均显示良好的分型结果。根据PFGE指纹图谱,52株气单胞菌可分为46个簇。来源于同一养殖场的不同鱼之间,底泥与鱼之间,猪粪、底泥与鱼之间都存在PFGE指纹图谱相同或相似的分离株,提示为同一克隆株。结论:应用PFGE分子分型技术,可适用于不同来源气单胞菌的相关性分析及克隆传播追踪。
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