【摘 要】
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通过对本实验室构建的鸭Ⅰ型疱疹病毒(duck herpesvirus type-1)DNA基因文库的重组质粒DNA序列测定,得到一段1077bp的完整ORF,经过生物信息学分析属于胸苷激酶(TK)基因。设计
【机 构】
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四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心,四川雅安 625014
【出 处】
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中国畜牧兽医学会动物微生态学分会第四届第九次全国学术研讨会暨饲料和动物源食品安全战略论坛
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通过对本实验室构建的鸭Ⅰ型疱疹病毒(duck herpesvirus type-1)DNA基因文库的重组质粒DNA序列测定,得到一段1077bp的完整ORF,经过生物信息学分析属于胸苷激酶(TK)基因。设计引物对该基因进行PCR扩增并克隆到pMD-18-T载体上,转化宿主菌DH5α,提取阳性重组质粒进行PCR、酶切鉴定并测序证明本研究获得了DPV TK基因。利用生物信息学软件GENSCAN、ProtScale、SignalP2.0、Scansite、TMpred、PROSITE、在线Predictprotein等对该基因分析表明DPVTK基因具有疱疹病毒的典型特征,含有ATP结合结构域和核苷酸结合结构域两个功能结构域,且该基因具有与功能相关的磷酸化位点和氨酰化位点,编码的多肽链中亲水区占据区域大于疏水区域,是一种膜外蛋白。利用DNAstar软件分析DPV TK基因与其他疱疹病毒TK基因序列同源性并绘制系统进化树发现DPVTK基因与禽类疱疹病毒(α-疱疹病毒)的进化关系最近。
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