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发酵是最具特色的炮制方法，但其相关原理研究十分薄弱。而与其一脉相传的传统食品目前已经从复杂多菌种发酵过渡到纯菌种发酵模式，并实现了生产规模的工业化，而且发酵过程的生化机理也比较明确。本文从发酵模式、发酵菌种和功能性成分等方面深入分析了食品发酵与中药发酵的关联性，以促进食品发酵的相关研究成果在中药发酵研究中得以应用，澄清发酵中药的研究思路，提高研究层次。