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近些年来，海洋保护区在渔业管理和生态系统保护上的作用得到了普遍共识。目前，基于生态系统的渔业管理方法正在世界范围中进行推广，而海洋保护区作为一种生态系统管理方法，在维护渔业资源的可持续利用方面与当今渔业管理存在着共通性。但关于海洋保护区运用于渔业管理中的研究在我国较少有学者涉及。本文论述了海洋保护区与渔业管理间的关系：海洋保护区可在生态、社会、经济多方面强化渔业管理目标；而渔业管理在海洋保护区的立法、建设、管理等过程中起着重要的作用；从理论的角度论证了了海洋保护区可以作为一种辅助性的渔业管理手段，并可以与其他渔业管理方法相结合使用，这不仅有助于推广基于生态系统的渔业管理方法，还能有利于促进渔业可持续性发展和生物多样性保护。