不同转移潜能人大细胞肺癌细胞株基因表达谱变化研究

来源 :中国抗癌学会肺癌专业委员会第十二届全国肺癌学术大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:rust123
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目的:本研究的目的旨在应用基因芯片比较不同转移潜能的人大细胞肺癌同源细胞株NL9980和L9981的基因表达谱变化,初步探讨不同转移潜能的人大细胞肺癌的基因表达特点及筛选转移相关基因,为肺癌的诊断、预后提供分子生物学指标,并从整个基因网络水平对肺癌的侵袭转移机制进行初步探讨. 方法:提取并纯化NL9980和L9981细胞的总RNA,以Oligo dT Frimer为引物反转录生成cDNA,然后经体外转录(IVT)生成标记有生物素的cRNA,纯化的cRNA片段化为35-200bp的小片段后与Affymetrix HG U133 Plus 2.0芯片杂交,经洗涤染色扫描后得到两个细胞的表达谱。应用GCOS软件比较两个细胞株的差异探针,将得到的差异探针进行注释,分类,信号通路分析,从中筛选转移相关的基因和信号通路。 结果:(1)通过NL9980和L9981细胞株基因表达谱的对比发现两个细胞株的绝大部分的基因表达和分布非常相似,从而也证实了两个细胞株是遗传背景相同的同源细胞株。(2)L9981细胞株与NL9980比较,从L9981细胞株中筛选到差异表达探针1274条。通过检索注释信息,找到有明确基因名称的基因970个,其中上调的基因有686个,下调的基因有283个,1个基因的两个不同转录本分别上调和下调。没有注释信息的探针90个,其中88个为EST序列。 结论:(1)不同转移潜能人大细胞肺癌细胞株NL9980和L9981具有不同的基因表达谱。(2)人高转移大细胞肺癌细胞株L9981中存在促进肺癌转移基因的过度表达和抑制肺癌转移基因的低表达。这些差异基因主要涉及侵袭转移、豁附、血管生成、细胞骨架、肿瘤形成和细胞生长、分化、凋亡以及与侵袭转移相关的信号通路。(3)需要对存在于L9981细胞株中的差异表达基因进行更深入的研究。
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Background and Objective: Tumor metastasis is not only the malignant marker and characteristics of lung cancer, but also the key cause of failure to cure and lose their life of thepatients with lung c
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Background and object: Lung cancer has a fastest growing rate of morbidity and mortality among malignant tumors and poses a great threat to the human health.Chemotherapy, as one of three major therapi
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