【摘 要】
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本文运用PCR-SSCP和克隆测序方法对中国3个不同地方类型的小型猪,即高原型的藏猪、华南型的滇南小耳猪、香猪的SLA-DQB基因外显子2(282bp)进行群体研究和序列多样性分析,共发现20个新等位基因,三猪种中多态变异位点有44个(30P+14S),β折叠区多态位点高于α螺旋区,3品种猪SLA-DQB等位基因的多样性(H=0.784)和核苷酸的多样度π值(Pi=0.035)均很高,H值高低依次
【机 构】
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中国科学院昆明动物研究所细胞与分子进化重点实验室,昆明 650223;佛山科学技术学院动科系,广东南海 52823;四川农业大学动物科技学院 四川雅安 625014
【出 处】
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2010广州-东莞首届国际小型猪学术论坛
论文部分内容阅读
本文运用PCR-SSCP和克隆测序方法对中国3个不同地方类型的小型猪,即高原型的藏猪、华南型的滇南小耳猪、香猪的SLA-DQB基因外显子2(282bp)进行群体研究和序列多样性分析,共发现20个新等位基因,三猪种中多态变异位点有44个(30P+14S),β折叠区多态位点高于α螺旋区,3品种猪SLA-DQB等位基因的多样性(H=0.784)和核苷酸的多样度π值(Pi=0.035)均很高,H值高低依次为：D＞X＞Z,Pi值高低依次为；X＞D＞Z。由于序列富含GC,特别是第三密码子富含GC,影响了密码子使用的偏向性。密码子总体看来颠换大于转换(主要集中在第二密码子,其次是第三密码子),已经达到饱和效应。采用Tamura三参数研究结果表明：类群内华南型遗传距离高于高原型,华南型与高原型遗传距离为0.0398。
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