政府职能转变以及财政体制的改革已经成为当前我国政府机构改革的重点,而其中预算绩效改革是财政改革的重点内容。特别是十九大报告中明确提出要“全面实施绩效管理”,充分表明党和国家实施全面预算绩效管理的决心。在此背景下,各行政事业单位也将财政预算绩效管理作为财政体制改革的重点,并不断根据本地实践情况进行探索。但是,目前全过程预算绩效管理在推进过程中仍存在不少问题。当前,我国各行政事业单位大力推进内部控制建设,若能在预算绩效管理改革中融入内控建设的内容,不断将内控建设的要求贯穿到绩效管理工作中,将能够大大提高目前预算绩效管理工作的水平。本文首先就研究背景、意义、综述、方法和内容以及相关概念作简要介绍。其次,分析目前我国开展预算绩效管理的现状及存在的问题,并通过比较分析的方法剖析厦门市开展预算绩效管理的现状及存在问题。再次,研究内部控制理论对预算绩效管理的作用,并探索预算绩效管理中的内部控制建设的内容,然后以厦门市为例,分析目前我国行政事业单位预算绩效管理与内控建设结合的现状。最后,基于内部控制视角,从五个方面提出优化行政事业单位预算绩效管理制度的建议。