利用系统发生足迹技术寻找巴西固氮螺菌基因组上的功能特征——基于客户/服务器模式的多机并行实现

来源 :2006年全国高性能计算学术会议(HPC 2006) | 被引量 : 0次 | 上传用户:lenchoguo
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巴西固氮螺菌是重要的植物促生内生菌之一.为了研究其未知基因,在巴西固氮螺菌和与其同源的五个菌种之间进行系统发生足迹研究.由于单机任务执行的串行性,效率较低.研究发现,整个过程包含了大量重复的、没有数据依赖的操作,如文本信息的提取,DNA序列的比较等.因此,提出了局域网环境下基于客户机/服务器模式的多机并行实现的思路.在充分利用资源的同时,显著提高了效率.
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