【摘 要】
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I will present an integrative, machine-learning method, incRNA, for whole-genome identification of non-coding RNAs (ncRNAs).It combines a large amount of ex
【机 构】
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MOEKeyLabofBioinformatics,SchoolofLifeScience,TsinghuaUniversity,Beijing,100084,China
【出 处】
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第五届全国生物信息学与系统生物学学术大会
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I will present an integrative, machine-learning method, incRNA, for whole-genome identification of non-coding RNAs (ncRNAs).It combines a large amount of expression data, epigenetics data, RNA secondary-structure stability, and evolutionary conservation at the protein and nucleic-acid level.Using this model, we were able to separate known ncRNAs from coding sequences and other genomic elements with high accuracy (>93% AUC on an independent validation set), and find thousands of novel ncRNA candidates in C.elegans and Arabidopsis .
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