不同致病力EIAV毒株的密码子及密码子对使用偏性分析

来源 :第十届全国病毒学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chen3712331
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  密码子偏性和密码子对偏性是基因组一级结构重要的特征。可对mRNA能否正确解码产生重要影响。在没有选择压力和中性突变的情况下,编码同一个氨基酸的几个同义密码子的使用频率应该相同。但实际上它们往往偏向于使用某一种或几种特定的同义密码子,这种同义密码子非均衡使用的现象称为密码子偏性(CUB)。密码子偏性的产生受突变压力,翻译选择压力,tRNAs的相对丰度,基因的碱基成分等多因素影响。而密码子对偏性则是指相邻近的密码子并非随机组合成密码子对,而是具有偏向性。对密码子偏性以及密码子对偏性的探究有助于了解生物体的分子进化并有助于了解RNA病毒和宿主诱导免疫应答的关系。
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