【摘 要】
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将猪源JEV SH0601株基因组RNA分五段进行RT-PCR并克隆入pCRⅡ-Blunt-TOPO和pBluescript载体中,测定了全长cDNA序列,并根据E蛋白基因序列对SH0601株进行了遗传分型。cDNA序列
【机 构】
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中国农业科学院上海兽医研究所/中国动物卫生与流行病学中心上海分中心,动物传染病防治研究室,农业部动物寄生虫重点实验室,上海市徐汇区,200232
【出 处】
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中国畜牧兽医学会动物传染病学分会第十二次学术研讨会
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将猪源JEV SH0601株基因组RNA分五段进行RT-PCR并克隆入pCRⅡ-Blunt-TOPO和pBluescript载体中,测定了全长cDNA序列,并根据E蛋白基因序列对SH0601株进行了遗传分型。cDNA序列分析结果表明:SH0601株基因组全长10977nt,与GenBank中的Bajing-1、P3、SA14和SA14-14-2株基因组全长相比,在3NTR的10701nt处多一碱基"G",与上述四株病毒的全长核苷酸的同源率都达97.2％以上,而与国外猪源分离株KV1899和JEV/sw/Mie/41/2002全长核苷酸的同源率仅达88.7％,但SH0601株与六株病毒的全长氨基酸同源率均达97.0％以上。以E蛋白基因序列对SH0601作进化分析,该分离株属基因型Ⅲ型。
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