DNA逃逸ɑ-溶血素纳米孔动力学无序的涨落瓶颈模型研究

来源 :中国化学会第30届学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:opp2781062
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  DNA逃逸ɑ-溶血素纳米孔实验发现DNA在纳米孔中残存概率的多指数衰减,意味着逃逸速率的含时涨落,即动力学无序。基于涨落瓶颈模型,将DNA穿孔过程描述为穿过一个涨落的瓶颈。假设DNA逃逸速率正比于涨落瓶颈的横截面积,由纳米孔涨落的半径决定归因于纳米孔构象在多个亚态之间的跃迁。运用一维广义朗之万方程,结合高斯分数噪声和幂律摩擦内核引入构象亚扩散描述瓶颈半径的随机演化。计算与实验结果可以直接比较的非单指数的平均残存概率、逃逸时间分布以及平均逃逸时间。将建立的理论应用于DNA逃逸ɑ-溶血素纳米孔实验研究,拟合DNA逃逸过程中的非单指数衰减的残存概率。结果表明,我们的理论能够在整个时间区域很好地拟合实验,估算了合理的本征动力学参数。涨落模型对DNA穿越纳米孔的非单指数动力学提供了更深层次的理解,并为类似受限空间中的俘获和逃逸问题提供了新的思路和视角。
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