【摘 要】
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为获得大口黑鲈与生长相关的SNP标记,应用于大口黑鲈分子标记辅助选择育种.本研究根据大口黑鲈(Micropterus salmoides) EST-SNP库中HBP基因的序列(GenBank accession NO.： KF652241),用直接测序法在HBP基因3非编码区获得了3个SNPs位点：Hl(G+2782T),H2 (T+2817C)和H3 (G+2857A).随机选择同批繁殖、同塘养
【机 构】
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中国水产科学研究院珠江水产研究所,农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室,广州510380;上海海洋大学生命与水产学院,上海201306
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为获得大口黑鲈与生长相关的SNP标记,应用于大口黑鲈分子标记辅助选择育种.本研究根据大口黑鲈(Micropterus salmoides) EST-SNP库中HBP基因的序列(GenBank accession NO.： KF652241),用直接测序法在HBP基因3非编码区获得了3个SNPs位点：Hl(G+2782T),H2 (T+2817C)和H3 (G+2857A).随机选择同批繁殖、同塘养殖的165尾大口黑鲈样本,用SnaPshot方法进行检测和分型,并用软件spssl7.0的一般线性模型(general linear model,GLM)与生长性状进行关联分析.结果表明,3个位点均处于哈温平衡,其中H1和H2位点组成了两种单倍型(A和B),观测到3种基因型(AA、AB和BB)；H1、H2和H3共组成6种双倍型(D1、D2、D3、D4、D5和D6).不同基因型与生长性状的相关性分析显示,基因型BB在体质量和全长形态指标显著高于基因型AB(P＜0.05),双倍型D6在体质量和全长形态指标显著高于双倍型D4 (P＜0.05).本研究在大口黑鲈HBP基因获得的与生长性状相关的SNPs标记可应用于其分子标记辅助选择育种.
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