烟酸受体G 偶联蛋白受体109A(GPR109A)是心血管疾病和脂代谢紊乱等疾病治疗的重要靶点蛋白,但因属于膜蛋白,其晶体结构一直未被解析,给药物设计带来挑战。本文基于鼠类PUMA-G 晶体结构,采用同源模建的方法构建GPR109A 的三维结构并运用Ramachandran Plot 和Profile-3D 对模型进行评估,通过加力场,加膜,loop 等方法对模型进行优化,得到最优模型并计算得到12 个可能的活性位点。利用SYBYL-X2 软件构建GPR109A 的吡唑类激动剂药物小分子,通过最陡下降法和共轭梯度法得到药物小分子的最稳定构象。用Libdock 方法将激动剂对接至蛋白各活性位点,获得二者作用模型。我们分析各活性位点氨基酸分布情况,并以3-羧酸5-甲基吡唑为参考分子探讨药物与各蛋白活性位点相互作用情况。本实验对设计G 偶联蛋白受体109A 吡唑类激动剂有理论指导意义。