猪妊娠14天子宫内膜测序数据的简单分析

来源 :中国畜牧兽医学会信息技术分会2013年学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jwliangbo
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猪的妊娠附植是由孕体分泌雌激素,维持整个妊娠阶段的功能黄体,导致孕体从球状胚到丝状胚发生明显的形态上的变化.胎儿的生长发育依靠着胚胎和母体相互之间复杂的分子机制.在妊娠附植时期PGE2保护黄体与PGF2.相拮抗,使子宫内膜中的PGE2∶PGF2.的比率增加.为了描述胎盘附植时子宫内膜转录组变化的特点,共测序8头长白纯种猪,分为妊娠组和发情周期的对照组,每组四个不同的生物学重复,对妊娠猪(n=4)的子宫内膜和相对应的发情周期猪(n=4)为对照组的子宫内膜RNA样品用高通量RNA-Seq的方法进行深度测序.RNA-Seq分析发现妊娠14天和相对应的发情周期14天的子宫内膜的转录组有复杂的差异变化,这些变化聚焦了附植时期新的变化和通路.
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