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人类白细胞抗原(HLA)基因系统是人类主要组织相容性复合体(MHC)，在维持正常免疫功能中具有重要的作用。丰富的多态性是HLA基因系统最重要的特点，其等位基因的频率在不同人种、不同民族及不同地域存在显著差异，因此人类免疫系统对同种抗原肽的免疫应答强度亦具有显著差异。HIV感染机体后CTL的细胞毒作用是机体抗HIV的主要免疫反应，因此有效地CTL反应是有效抑制病毒复制和控制病程进展的关键。因为CTL反应具有HLA限制性及HLA具有丰富的多态性，所以感染者表达的等位基因不同时，其免疫系统抗HIV的免疫应答的强度不同，即HLA与HIV感染后的病程进展具有密切的关系，但两者相关性的具体机制尚不清楚。