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食品中的致病微生物和农兽药残留，被认为是食品安全的主要威胁.食源性疾病、食品污染是危害公众健康的重要因素.2000～2002年中国疾病预防控制中心营养与食品安全所对全国部分省市的生肉、熟肉、乳和乳制品、水产品、蔬菜中的致病菌污染状况进行了连续的主动监测，结果表明，微生物性食物中毒仍居首位，占39.62％，化学性食物中毒占38.56％，动植物性和原因不明的食物中毒均在10％左右.因此，从生产源头到餐桌，必须对可能威胁或损害人体健康的物质和因素进行有效监督.食品安全和环境卫生监控对检测手段提出了便捷、高效、准确、快速的要求，生物芯片可以很好地满足这些要求.