甘蔗种质资源分子身份证及SSR指纹数据库的构建

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甘蔗指纹数据库的建立,不仅为育种工作者和品种测试单位提供了一个便利的数据共享平台,也为甘蔗品种鉴定及其知识产权保护,提供科学依据,还可为未来行业标准——甘蔗分子标记DUS指南的制定奠定基础。本研究利用7个gSSR和8个EST-SSR作为基础核心引物,对181份甘蔗种质资源进行了SSR分析。根据引物在181份甘蔗种质中扩增片段大小的不同而产生的多态性,构建分子身份证和指纹图谱,该分子身份证由121位0-1数字组成,代表了15对SSR基础核心引物在该品种中的扩增条带分布情况。此外,研究还根据品种的身份证信息构建了具有查询功能的甘蔗SSR指纹数据库,该数据库包含了3个基础数据库:引物数据库、品种数据库和DNA指纹图谱数据库,其中DNA指纹图谱数据库主要包括2 715个0-1组成的分子ID和2 715张毛细管电泳图。研究所建立的SSR指纹数据库,不仅具有品种基本信息查询、品种分子身份证查询、品种间相似率查询和品种鉴别等基本功能,还可为基于甘蔗分子标记DUS指南的品种鉴定和品种权保护提供一个查询平台。
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