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目的：评估结核分枝杆菌可变串联重复序列(VNTR)高变位点在结核菌传播过程中的克隆稳定性.方法：对上海市松江区及黑龙江省五常县2009-2010年收集的结核菌株进行9位点VNTR分型;对鉴定的32个来自两个最大簇的菌株进行3个高变位点(VNTR 3232,VNTR 3820和VNTR4120)分型及全基因组测序;通过分析高变位点和基因组成簇的一致性评估高变位点的克隆稳定性.结果：32个菌株的高变位点及全基因组呈现较高的多态性;基因组成簇(基因组差异≤5突变)的菌株中,高变位点的一致性达100％.结论：高变位点具有较好的克隆稳定性,适合用于研究结核菌的近期传播.