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在基于鸟枪法鉴定蛋白的策略中，需要在肽段水平上进行高效良好的预分离。以人多巴胺能神经细胞瘤(SH-SY5Y)为研究对象，考察了游离胶分馏器(OFFGEL)分离肽段的性能。SH-SY5Y细胞全酶切肽段经过OFFGEL分离后，得到24个不同馏分，每一个馏分经过微流液相色谱-质谱检测，发现有83.7％的肽段是专属于一个馏分中，各个馏分中肽段平均等电点与理论值基本一致，且在pH低端肽段的等电点偏差较小，达到良好的聚焦效果。OFFGEL不但能同时分离多达16个样品，而且能够从溶液中回收样品，具有高通量、操作简单、方便后续质谱检测等优点。因此，OFFGEL在蛋白质组学中多肽的分离具有很好的应用前景。