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浮游植物是海洋最主要的初级生产者，初级生产过程启动海洋的物质循环和能量流动，通过一系列复杂过程(如海洋生物泵、海-气交换)，最终影响海洋对大气CO2的吸收，从而对气候系统起调控作用。海洋中尺度物理过程(如上升流、冲淡水、涡旋等)将影响浮游植物群落结构，进而影响初级生产过程和生物泵效率，是当今海洋生态学与全球变化的热点研究课题。采用高效液相色谱特征光合色素分析技术，同时结合分子探针技术，较系统地研究了中国海典型海域(包括黄海、东海、台湾海峡、南海北部与西部等)浮游植物群落结构及其演变特征，本文重点探讨南海中尺度物理过程(上升流、涡旋)对浮游植物群落结构的影响。