2002年被列为泉州市的重要饮用水源地后,山美水库库区内养鱼网箱被彻底清除,四周绿化补种,改善库区植被,改变传统渔业发展理念,开展"以渔治水,以渔养水"的保水渔业。库区水质良好,与2003年相比,2012年库区水质NH₄^-N和TN分别下降了64.0%和55.8%;从库区上游到大坝7个站点水样NO₂^-N、NO₃^-N、NH₄^-N、TN、COD和TP含量与库外东美站点相比,分别下降了83.9%、16.1%、90.5%、42.6%、27.0%和28.7%,其中NO2-N、NH4-N、TN、COD和TP差异显著（p<0.05）。叶绿素a含量从库外东美站位经库区上游的高平、土楼至库区下游的大坝急剧下降,到水库渔业主要区域的杜潭、大湾、九都、井角和大坝下降了67.2%,差异显著（p<0.05）。库区鱼类生长迅速,鳙鱼VonBertalanffy生长方程为:Lt=107.2167×[1-e^{-0.1349（t+0.1561）}], Wt=22095.9566×1-e^{-0.1349（t+0.1561）}]^2.9132,翘嘴红鲌Von Bertalanffy生长方程为:Lt=120.5981×[1-e^{-0.0913（t+1.09）}],Wt=21.9368×[1-e^{-0.0913（t+1.09）}]2.825;水库鱼产量逐年上升,平均年渔产量441.0t,渔获物中鲢鱼产量占28.%,鳙鱼产量占66.3%,翘嘴鲌、鲤、鲫等占4.90%,沼虾占0.76%。库区生态系统稳定,有浮游植物7门共69种,平均数量436.88×10⁴个/L,生物量为2.98 mg/L;浮游动物39种,平均数量350.48个/L,生物量为3.98 mg/L,库区内现有鱼类10科37种。山美水库保水渔业的实践科学合理地开发了库区渔业生长和水源地的有效保护。