四面体DNA折纸在固态纳米孔中的探测及信号特征

来源 :中国物理学会2015年秋季会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:heyfeng
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  DNA折纸(DNA origami)是依靠碱基互补配对原则自组装形成的各种二维或三维纳米结构。将这种纳米结构与DNA的特定位点结合,可用于探测并判断DNA目标基因的变异或错位,在基因检测和疾病诊断等方面具有潜在的应用价值。为实现这一目标,DNA折纸结构与DNA结合位点的定位探测是一个关键。利用折纸结构与DNA空间结构的不同,纳米孔有望为结合位点的定位提供一个快速而简单的新颖测量手段。为此,我们研究了四面体DNA折纸及其DNA结合体在固态纳米孔中的运动规律和信号特征。利用2~7nm的纳米孔测试四种不同尺寸的四面体DNA折纸的纳米孔离子电流信号,发现5nm左右的孔能提供最优的信号,阻孔电流深度保持高度一致,信噪比有显著提高。边长较长的四面体在穿孔过程中更易发生折叠且穿孔等效直径随四面体边长的增加而增加。进一步,我们将边长为7bp的正四面体折纸(T7)通过碱基互补结合到长度为7560bp的线性双链M13DNA的一端作为标记,测试其在纳米孔中信号规律。实验发现绝大部分结合体穿越纳米孔的离子电流信号清晰地分为折纸与链状DNA两个部分。事件信号的分析表明:四面体折纸T7带着DNA双链M13依次穿过纳米孔;T7阻孔等效直径约为M13的二倍;T7穿孔时间约为M13的10%。这些研究结果为下一步利用四面体折纸结构确定DNA特定位点提供了重要的基础。
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