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为了研究烤烟烘烤过程对微生物群落结构的影响,本研究以云烟87为材料,采用Miseq高通量测序技术,分析了不同烤房烘烤过程中微生物的群落结构及其变化。结果 表明,A、B、C三个烤房的OTU(Operational Taxonomic Units)大部分都是共有,B烤房独有OTU较少,C烤房独有OTU较多。通过分析各样本中微生物群落组成的相似性和差异性发现,芽孢杆菌(Bacillus)为三个烤房的优势菌群。烘烤过程中部分微生物物种群落结构差异较大,如马赛菌属(Massilia)、根瘤菌(Rhizobium)、寡养单胞菌(Stenotrophomonas)等。进一步主成分分析显示,烘烤前期和后期样本有比较明显的区分,微生物组成差异明显。该结果为进一步针对性的利用这些优势细菌以提高烘烤烟叶质量奠定了基础。