[目的]：马尾藻品种较多,很难从形态上对其鉴定,本文对三亚湾的瓦氏马尾藻进行分子鉴定,研究其附生细菌的多样性,为进一步分析藻与共附生微生物之间的关系打下基础。[方法]：采用分离培养的方法和基于16S rDNA基因序列分析的方法。[结果]：本研究获得87株细菌分离株,序列比对及系统进化树分析结果表明：26株分离株序列与Apha proteobacterium(变形菌)相似度为99％的菌种,占总菌种数的比重最大(30％),为优势菌；2株菌株的序列与单胞杆菌序列相似度为99％,A1-62株与Labernzia的序列相似度99％,7株菌株与海洋螺杆菌为同种菌,2株与发光杆菌同源度为99％,4株菌株的序列与Rugeria的序列相似度99％,A-154株与黄杆菌为同种菌,A-14菌株序列与Ruegeria(鲁杰氏菌)序列的相似度为100％,为同一种细菌,21株菌株与Thalassob ius为同种菌,A-93菌株与弧菌同源相似度84％,余下20株对比序列的相似度低于99％,Al-140与Alpha proteobacterium(DQ227660),相似度分别为75％,疑为一种未知菌株。[结论]：瓦氏马尾藻附生的细菌的种类是多样的,构成一个复杂的生态群落。其中Alpha proteobacterium的数量最多,这种菌营养类型多种多样,有光合种类,还有与动植物共生种类,Atpha proteobacterium含有分解藻类分泌的酸类、醇类、糖类化合物的酶。