全人源 ／人源化治疗性抗体片段(Antibody Fragment)在细菌宿主细胞中的高效、高质量可溶性表达是当今生物医药过程工程研究中的一个挑战.从过程研究的角度来看,目前存在的主要问题是：1)尚未有一个普适性的系统理论可以指导针对一个给定的目标蛋白来选择最佳的表达体系,进而快速建立一个稳定的蛋白表达过程；2)FDA要求对申报注册蛋白药物的表达过程的深度理解,包括PAT技术的应用.所以在实际操作中,目前人们普遍使用的技术手段是“试错法”(Trial& Error),即在基因、质粒载体、宿主细胞、蛋白分泌效率和过程工艺等五个方面上的多种参数组合模式,构建、筛选工程菌株,建立优化的过程参数,其过程耗费大量的人、物力和时间.该过程包括：1)优化目标蛋白的AA碱基编码—使用E.coli高频率使用的AA编码,进而提高编码相关的翻译效率、mRNA的稳定性和宿主细胞的健康状态,提高基因表达效率.2)选择不同的质粒骨架、启动子、核糖体结合位点(RBS)、转录终止子、抗生素耐受基因和使用基因融合伴侣等来构建新的质粒；或直接尝试多种商业化质粒.3)选择商业化的E.coli变种,例如BL21及其变种K-12,OmniMAX2和W3110及其变种等；或者有针对性地改造E.coli宿主细胞,例如敲除蛋白酶、简化基因组构建新细胞工厂(Cell factory).4)提高外源表达蛋白的分泌效率,筛选不同来源的信号肽和改变宿主细胞外膜的通透性等.5)过程培养条件优化等.