海南辣椒上Potyviruses的株系多样性分析

来源 :中国植物病理学会2015年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:acmilanno1
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  为澄清侵染海南辣椒的马铃薯Y病毒属病毒的株系和亲缘关系,我们克隆了多个辣椒样品上的ChiRSV、PVMV和ChiVMV 3种Potyviruses的CP基因,进行了序列多态性分析.以CP基因为基础,结合GenBank中已登录的各病毒CP基因序列,运用最大似然法,构建各病毒的系统进化树.结果表明:ChiVMV各分离物能分成4组,分别命名为Group 1、Group 2、Group 3和Group 4,ChiVMV海南分离物之间的CP基因序列一致性大于98%,是一个株系,且属于其中的ChiVMV Group 1株系;根据系统进化树,ChiRSV海南分离物的CP基因分成两个有差异的簇,各簇内的ChiRSV CP基因序列一致性高,但簇与簇的分离物之间的CP基因序列与CP氨基酸序列一致性分别为91.6%~100%,92.9%~100%,因此海南辣椒上存在两个ChiRSV株系,暂命为ChiRSV Ⅰ组与ChiRSV Ⅱ组;PVMV海南分离物CP基因序列一致性大于98%,聚为一簇,属于一个PVMV株系,暂命为PVMV亚洲组.
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