3株高致病性猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒Nsp2、ORF5基因的克隆与变异分析

来源 :第二届京津冀畜牧兽医科技创新论坛暨第六届新思想、新方法、新观点“首农杯”论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zzzaaaqqq1314
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  用RT-PCR方法扩增3株山西高致病性猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒毒株的Nsp2和ORF5基因,并将其克隆入pGEM-T载体进行测序。对测序结果与国内外7个毒株等位基因的序列进行比较分析,结果表明:Nsp2基因中存在90个核苷酸的不连续缺失,由ORF5编码的GP5蛋白的主要氨基酸基序也发生了变化;SXI、SX2、SX3的Nsp2、ORF5基因与JXA1、HUB2、VR-2332、CH-1a、HB-1等7个毒株等位基因的核苷酸同源性为81.8%~99.3%和88.2%~99.3%,推导的氨基酸同源性分别为74.4%~99.2%和88.0%~98.0%。遗传进化树分析表明,SX1、SX2、SX3与JXA1、HUB2亲缘关系最近,与HB-1亲缘关系较近,与VR-2332、BJ-4、CH-1a、HB-2亲缘关系较远。
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