【摘 要】
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半枫荷具有重要药用价值,但由于缺乏其基因组信息,限制了其分子生物学、基因功能与分子育种等相关研究.本研究以半枫荷茎为材料,利用Illumina高通量测序技术进行转录组测序,获得了112361条Unigene,总长度为94018066bp,平均长度为836.75bp;对转录组ALL-Unigene的CDS进行BLAST分析,共发现了52107个Unigene片段;与Swiss-Prot数据库相比较,
【机 构】
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湖南省森林植物园,长沙市,410116
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半枫荷具有重要药用价值,但由于缺乏其基因组信息,限制了其分子生物学、基因功能与分子育种等相关研究.本研究以半枫荷茎为材料,利用Illumina高通量测序技术进行转录组测序,获得了112361条Unigene,总长度为94018066bp,平均长度为836.75bp;对转录组ALL-Unigene的CDS进行BLAST分析,共发现了52107个Unigene片段;与Swiss-Prot数据库相比较,检测出33624个蛋白同源序列;与COG数据库比对,发现20060条Unigene被COG功能注释,共分为24类;进行GO功能分类分析,发现31125条Unigene注释到GO数据库中;进行KEGG功能注释,发现12987个Unigene参与了101条代谢通路;进行SSR位点搜索,共检测到33190个SSR位点,且SSR的类型丰富.这些研究结果极大地扩充了半枫荷的基因资源,为半枫荷药用基因的发掘与利用、分子标记的开发及其种质资源遗传改良等研究提供了重要基础.
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