山茶属植物SSR、EST-SSR序列分离及分析

来源 :2016大理国际茶花大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:valgrind2
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本研究通过SSR、EST-SSR分子标记技术对179种山茶属植物进行亲缘关系分析.采用改良的CTAB法提取179种茶花基因组DNA,用1%的琼脂糖凝胶电泳检测DNA纯度,用2%的琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物.扩增产物测序结果显示,EST-SSR序列片段大小为194bp,序列最长的是崇左金花茶,长度为210bp,序列最短为凹脉金花茶,长度为152bp.在NCBI上寻找同源系列,用ClusterX软件进行系列比对,发现不同山茶属植物EST-SSR系列差异较大,其中缺失位点为1752个,突变位点813个.用MEGA6.0软件画系统树,对山茶进行亲缘关系分析,39种山茶聚为红山茶组、金花茶组、糙果茶组、连蕊茶组四组,结果与张宏达形态学分类结果基本一致.说明EST-SSR分子标记能用于山茶系统分类及物种鉴定.
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