【摘 要】
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目的 利用数据库和临床分离的志贺菌来分析志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR)的特点,探索CRISPR-Q1的特性和CRISPR间的关联性.方法 利用引物序列和PCR扩增获得志贺菌CRISPR序列,采用多序列比对等方法获得每个菌株中CRISPR的分布,间隔序列数目及序列特点;利用BLAST来分析CRISPR-Q1中重复序列和间隔序列在一个菌株中的分布特点以及CRISPR-Q1在菌株中
【机 构】
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郑州大学公共卫生学院流行病学教研室 河南科技大学医学院公共卫生教研室
【出 处】
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第四届全国分子流行病学暨第八届晋冀鲁豫流行病学学术会议
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目的 利用数据库和临床分离的志贺菌来分析志贺菌中成簇的规律间隔短回文重复序列(CRISPR)的特点,探索CRISPR-Q1的特性和CRISPR间的关联性.方法 利用引物序列和PCR扩增获得志贺菌CRISPR序列,采用多序列比对等方法获得每个菌株中CRISPR的分布,间隔序列数目及序列特点;利用BLAST来分析CRISPR-Q1中重复序列和间隔序列在一个菌株中的分布特点以及CRISPR-Q1在菌株中的位置及特征;利用SPSS来分析CRISPR-Q1中间隔序列数目与CRISPR1或CRISPR2间的联系.
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