2016年广东地区猪流行性腹泻病毒流行毒株遗传进化分析

来源 :2016第六届中国兽药大会(中国畜牧兽医学会动物药品学分会第五届全国会员代表大会暨2016学术年会、中国微生物学会兽医微 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lulubukule
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  为了解2016年广东地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的变异情况,对临床分离的一株PEDV的S、N、M及ORF3基因进行克隆和测序,并进行了生物信息学分析.分析结果表明,检测的一株PEDV(以GD/JMEP表示)与经典的CV777毒株亲缘关系较远,与近几年广东流行的PEDV毒株处于一个群,亲缘关系较近.通过ORF3序列分析发现,未有核苷酸的缺失,推测为PEDV强毒株.N、M基因核苷酸和氨基酸同源性分析发现,GD/JMEP与EAS1等经典毒株的同源性相对较低,与2013-2015年中国、美国、韩国等流行毒株的同源性较高.相比于经典传统毒株,GD/JMEP在S基因的几个位点存在核苷酸的缺失或者插入,与目前流行毒株比较,在S基因的406位点存在新的突变,表明本实验检测的PEDV为目前广东变异流行毒株,预示广东地区流行的PEDV基因在不断发生变化.
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