【摘 要】
:
目的:对深圳地区手足口病(Hand,Foot and MouthDisease,HFMD)肠道病毒71型分离株(Enterovirus 71,EV71)的VP4基因遗传进化进行分析。方法:2009年采集深圳市儿童医院就诊的HFMD
【出 处】
:
第三届传染病防控基础研究与应用技术论坛
论文部分内容阅读
目的:对深圳地区手足口病(Hand,Foot and MouthDisease,HFMD)肠道病毒71型分离株(Enterovirus 71,EV71)的VP4基因遗传进化进行分析。方法:2009年采集深圳市儿童医院就诊的HFMD患者的粪便标本49l份,选取其中8份经细胞培养鉴定为阳性的EV71毒株用RT—PCR扩增’VP4基因,利用MEGA4.0软件进行遗传进化分析。结果:2009年深圳地区8株Ev71 VP4基因全长207bp,编码69个氨基酸;8株EV71 VP4基因核苷酸同源性在94.2%~98.1%,与深圳2001年~2004年分离的17株EV7l毒株核苷酸同源性在89.9%~98.1%,与GenBank中其他EV71病毒株VP4的核苷酸同源性在79.2%~100%;其中与亚洲流行株阜阳株(EU703812)核苷酸的同源性最高(100%),其次是C4代表株及2004年深圳株(AY895144)94.2%~97.1%。,除了印度株和其中1株EV71的VP4编码的氨基酸在第54位(ACA)不同之外,其余7株EV71 VP4编码的氨基酸序列之间以及与GenBank报道的其他序列同源性达100%。8株EV71 VP4基因核苷酸与C4代表株相比有17处不同,除1处以外其余全在简并密码位点上;轻重症病例毒株之间VP4基因序列未见明显改变。进化树显示8株EV71均属于C4基因亚型。结论:2009年深圳市流行的EV71属于C4基因亚型,流行的EV71VP4基因非常保守,不属于变异区段,绝大部分核苷酸的变异属无效变异,VP4基因编码的氨基酸变异几乎为零。
其他文献
目的:对5个2型糖尿病(T2DM)患者相关易感单核苷酸多态性(SNP),分析与2型糖尿病有关的遗传因素。方法:选取185名2型糖尿病患者和100名健康对照组,采取外周血并提基因组DNA,采用
目的:利用天津市某区2008—2011年手足口病疫情资料,进行流行病学特点和相关因素分析,为手足口病预防控制工作提供科学依据。方法:资料来自中国疾病监测信息报告管理系统,采用
本文以研究细菌基因组和基因的进化事件为目的,提出即将一个蛋白序列转换成一个或多个“模块”,然后基于这些“模块”分析基因组和基因的进化事件。通过比较不同蛋白序列的
目的:构建汉坦病毒包膜糖蛋白序列数据库,针对汉坦病毒包膜糖蛋白序列进行多态性及正选择位点分析。方法:对构建的汉坦病毒包膜糖蛋白序列数据库中所有完整的包膜糖蛋白序列
夏季采用降温遮阳法,与玉米、豆角或芋头套种蒜苗,能在双节上市,苗高约55厘米,667平方米产蒜苗3000~3500公斤,最高可达5000公斤。其主要栽培技术是: 一、选用良种 早播蒜苗要
清明节刚过一天,祭奠先人的泪水还没有干,即从电视上看到了周海婴先生离世的报道。我简直不相信自己的眼睛。因为节前我还与上海鲁迅纪念馆的领导联系,说起海婴先生最近比较
物联网作为互联网时代迅速发展下的新型信息技术,具有一定的技术特性与健全的技术结构,同时形成了较为完善的应用模式.在我国通讯网络与信息技术迅速发展的过程中,物联网也在
代表简介:廖周旭,男,汉族,合肥市瑶海区第二届人大代表。四川省阆中市人,中共党员,西北大学国民经济管理专业毕业,大学学历,会计师、经济师,中科大EMBA在读。现任中国石油天
Salmonella can cause illnesses in humans and many animals.Thecurrent diagnostic gold standard used for detecting Salmonella infection ismicrobi010gical culture f
目的:了解上海市疑似重症手足口病患儿的肠道病毒感染的型别特征。方法:用荧光PCR技术检测肠道病毒EV71,CoxA16基因,同时收集流行病学资料,用SPSS进行统计分析。结果:319例疑似