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目的：建立5种卷柏属植物药的总黄酮及穗花杉双黄酮含量测定方法，比较不同种之间的含量差异，初步探讨采收期对总黄酮及穗花杉双黄酮含量的影响。方法：以穗花杉双黄酮为对照品，采用紫外-可见分光光度法和HPLC法分别测定5种卷柏属植物药中总黄酮及穗花杉双黄酮的含量。结果：同一产地(湖北宜昌车溪)5种卷柏属植物药总黄酮及穗花杉双黄酮含量差异较大；采收期分别为7月和10月的5种植物药总黄酮及穗花杉双黄酮的含量有一定差异。结论：建立的含量测定方法精密度好，准确度高。研究结果为卷柏属植物药的质量评价提供有价值的参考；同时，根据采收期对总黄酮及穗花杉双黄酮含量的影响，初步认为异穗卷柏和薄叶卷柏宜在秋季采收，江南卷柏宜在夏季采收，翠云草和疏叶卷柏夏秋季采收对其质量影响不大。