【摘 要】
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目的 筛查恒河猴tetherin基因编码区单核苷酸多态性(coding-region single nucleotide polymorphism,cSNP),研究其对蛋白结构和功能的影响.方法提取恒河猴外周血RNA,RT-P
【机 构】
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北京协和医学院比较医学中心,中国医学科学院医学实验动物研究所,卫生部人类疾病比较医学重点实验室,国家中医药管理局人类疾病动物模型三级实验室,北京100021
【出 处】
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2014第十一届中国实验动物科学年会
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目的 筛查恒河猴tetherin基因编码区单核苷酸多态性(coding-region single nucleotide polymorphism,cSNP),研究其对蛋白结构和功能的影响.方法提取恒河猴外周血RNA,RT-PCR扩增,单克隆测序比对,确定猴tetherin的cSNP位点；通过蛋白质结构分析软件对蛋白结构进行预测；比较不同基因型猴SIVmac239复制水平的差异.结果 序列比对发现8个非同义突变位点；经Psipred软件预测,其中G41A、T128C、C129和A333C cSNP位点可影响Tetherin蛋白二级结构.在SIV-mac239感染平台期,参考基因型猴(DLQ)病毒复制水平要高于GLQ型猴(p＜0.05),其他基因型猴之间无显著差异.结论 cSNP(G41A)可能影响Tetherin的抗病毒功能,这为后续研究提供参考信息.
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