广西候鸟H5N6亚型流感病毒的序列分析

来源 :中国畜牧兽医学会兽医公共卫生学分会第五次学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shengyu0128
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  本研究采用RT-PCR的方法对广西桂林、百色、北海3个地方采集的候鸟的粪便棉试纸进行流感病毒的检测,从234份粪便样品中检测出4份阳性,阳性率为1.71%;其中一份来自桂林的样品,通过8个基因片段的克隆和序列测定,鉴定为H5N6亚型禽流感病毒,命名为A/Little egret/Guang xi/G1/2014(简称G1).其中HA、NA、M、NP、NS、PA、PB1、PB2的核苷酸ORF分别为1704bp、1380bp、982bp、1497bp、823bp、2151bp、2274bp和2280bp.G1与中国鸭源分离株A/duck/Eastem China/S0908/2014/H5N6的核苷酸和氨基酸同源性都在99%以上.
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