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南岭是广东北部的天然屏障,南北方生物物种的集中地带和交错地带,处于生物起源和分异的中心地带,长期高温高湿的气候与复杂多样的山地森林为野生动物的生存与繁衍提供了适宜生境.南岭具有悠久的生物发展历史,是古热带动植物的避难所和近代东亚温带、亚热带植物的发源地.南岭自然保护区地势北高南低,地形复杂,山地、峡谷、盆地、平原俱全,森林类型多样,保存着南亚热带季风常绿阔叶林、沟谷雨林、针阔叶混交林、针叶林和山顶矮林等森林植被类型.是广东目前保存面积较大的原始林和原生性较强的次生林分布区域.是我国生物多样性关键地区之一,在生物进化史中具有特殊的地位.据统计,该保护区有陆栖脊椎动物529种,隶属27目86科287属,占全国陆栖脊椎动物种数(2638种)的20.05％.其中,兽类有9目25科64属95种,占广东省兽类总种数(124种)的76.6％(徐龙辉等, 1989)；鸟类有16目44科181属288种,占广东省鸟类总种数(504种)的57.14％(徐龙辉等,1989)；爬行类有2目13科52属99种,占广东省陆生爬行类总种数(145种)的68.28％(黎振昌等,2011)；两栖类有2目7科25属47种,占广东省两栖类总种数(68种)的69.12％(黎振昌等,2011).鱼类58种,隶属于5目14科48属；昆虫16目2785种；陆生贝类10科27属39种；南岭华溪蟹一新种.近年来不断有无脊椎动物新种发表,广东省脊椎动物新纪录不断发表.从1997年以来,共有48种广东省陆柄脊椎动物新纪录.南岭国家级自然保护区陆栖脊椎动物中国特有物种57种.莽山烙铁头、莽山后棱蛇、莽山角蟾、宜章臭蛙等四种是分布于湖南莽山和广东南岭的这一地区的特有物种.南岭国家级自然保护区受保护动物较多,其中国家一级保护动物有11种,二级保护动物有64种,省级保护动物26种.列入中国物种红色名录的的15种,其中极危(CR)7种,濒危(EN)23种,易危(VU),63种,近危(NT)57种.列入IUCN2003的83种.其中极危(CR)2种；濒危(EN)13种；易危(VU)21种；低危(LR)28种；无危(LC)18中；数据不清(DD)1种.列入CITES附录Ⅰ的16种,附录Ⅱ的35种；附录Ⅲ的13种.