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乳腺癌是女性健康的头号杀手；目前临床上用Her-2/neu和CA 15.3用于其早期诊断，但二者的灵敏度都不到60％；灵敏度更高标志物的发现是当前研究的一个重点，差异表达N-糖蛋白的发现是其中的重要研究内容.作者课题组前期在结构特异性N-糖组学研究[1-5]的基础上，发展了以完整N-糖肽数据库搜索引擎GPSeeker为中心的位点和结构特异同位素标记定量N-糖蛋白质组学分析流程[6、7]；并成功发现了肝癌(HepG2相对于LO2细胞系)[6]和乳腺癌癌症干细胞(MCF-7 癌症干细胞相对于MCF-7细胞)[8]的位点特异性潜在N-糖蛋白质标志物.