中国美利奴羊在品种培育过程中和品种育成以后一直广泛采用了品系繁育的方法，对巩固品种的遗传性，不断提高品种的生产性能取得了显著的效果，其中A型品系系采用一只公羊建系，品系的主要特点为体格大，污毛量高。B型品系采用生产性能相似的3只公羊建系，品系的主要特点为羊毛品质好，它是用含波尔华斯血液较多的中国美利奴(新疆军垦型)做母本，加入澳洲美利奴公羊血液，后代进行横交选育而形成的品系。本研究通过对中国美利奴(新疆军垦型)A系、B系遗传多样性检测、平均有效等位基因数、平均杂合度等以及其基因和基因型的分析，显示了两个类型绵羊都表现出了不同程度的多态性，说明有效等位基因数多的类型羊，其杂合度和多态信息含量也高;PIC值的大小与杂合度的高低也体现了较高的一致性。本试验平均遗传杂合度为0.7137和0.7676，说明中国美利奴(新疆军垦型)羊A系和B系遗传群体变异程度适中。群体的遗传变异就其本质而言，是DNA分子的遗传变异，不同品种或不同类型在遗传上的差异可不同程度地反映在其DNA序列上，体现出了在DNA水平上检测群体的遗传变异，研究群体间的遗传相关的重要性。