用分子克隆技术从兔出血症病毒(RHDV)中国早期流行株NJ85中成功克隆出VP60基因,序列分析表明该基因长度为1740nt,编码579aa.利用GenBank数据库,NJ85与WX84、TP二个RHDV中国毒株VP60基因DNA序列的同源性分别为92.7％和97.2％,氨基酸序列的同源性分别为96.1％和98.6％,与其他国家16个毒株的VP60基因DNA序列的同源性在83.7％~97.0％之间,氨基酸序列的同源性在90.5％~99.0％之间,具有高度的同源性.进一步分析VP60基因的六个分区,A、B、D、F四个区变异率较低,C、E二个区变异率较高.在遗传进化上,历年来的RHDV毒株在氨基酸水平上分析可分为三个支谱系,在核苷酸水平上趋向四个支谱系,谱系没有呈现地域或时间特征.三个中国毒株分布在二个不同的支谱系中.与RHDV同为兔病毒属的欧洲野兔综合征病毒(EBHSV)组成了另一个谱系.运用生物信息学方法分析了NJ85 VP60蛋白的分子量、等电点、疏水性和二级结构,用国际公认方法--根据同源模型预测分析了三级结构.NJ85 VP60的二级结构以β片层为主,三给结构稳定.病毒衣壳表面有32个杯状凹陷,由90个二聚体组成,二聚体由VP60单体以A/B5和C/C2两种方式构成,单体在二聚体中的构象有A、B、C三种形式.单体含有S、P两个结构域,两者通过柔性绞链连接,P结构城由VP60的C端部分形成,P分为P1和P2二个亚结构域,P2位于病毒衣壳表面,含有病毒株特异性抗原表位和红细胞结合位点.