耕地是区域粮食安全与生态安全的重要保障，但耕地的生态价值往往被当作外部价值而被忽视，使耕地的比较效益低下，为非农化提供了潜在的条件，因此，为使耕地的外部效益内部化，可以通过耕地的生态补偿促进区域的公平均衡发展.本研究主要基于参照因子法以及耕地生态足迹模型对湖北省2015年16个市(州)的耕地生态服务价值进行测算，并对跨区域的生态补偿进行研究.结果 表明：武汉市、襄阳市、荆门市、黄冈市、咸宁市、随州市、潜江市、仙桃市以及天门市是耕地生态服务价值的主要输入区，因此需要支付相应的耕地服务价值，分别为1.09亿元、0.93亿元、21.76亿元、3.79亿元、3.57亿元、26.81亿元、3.10亿元、6.67亿元以及5.36亿元，而黄石市、十堰市、荆州市、宜昌市、鄂州市、孝感市以及恩施州为耕地生态盈余区，是耕地生态服务价值的主要输出区，因此需要得到相应的耕地生态保护补偿，其相应得到的补偿金额为1.17亿元、4.11亿元、2.72亿元、2.16亿元、7.28亿元、5.78亿元以及3.85亿元.