结合福建省“908专项”，于2006年12月-2007年1月对福建省沿岸近海的浮游植物群落结构进行了大面积科学调查研究。结果表明，冬季福建近海浮游植物隶属于55属112种(含变种、变型、包囊)，其中硅藻48属97种(含变种、变型)，甲藻5属lO种(含包囊)，蓝藻l属2种，金藻1属3种。硅藻类在种类和数量上均占主导地位，优势种以硅藻类为主，柔弱根管藻(Guinardiadelicatula)、具槽直链藻(Paralia sulcata)、中肋骨条藻(Skeletonema costatum)、长细柱藻(Cylindrotheca closterium)、中华盒形藻(Rhizisolenia sinensis)、密联角毛藻(Chaetoceros densus)、菱形海线(Thalassionema nitzschioides)等。硅藻类在调查海域各个站位均有分布，甲藻类在闽中近海及东山沿岸分布较多，蓝藻类出现频率降低，金藻类出现频率相对增高。表层浮游植物平均数量为422.31×100cells.dm-3，数量分布呈南部高，中部次之，北部低的状况，南部和中部由近岸向远海增大，北部除了闽江口高数量区以外，近岸与远海差别不大。叶绿素口与浮游植物数量分布在闽中、闽北近海不一致，与优势类群的水平分布也有异。福建近海赤潮生物种类较多，是引发赤潮的潜在生物因素，一些赤潮生物已在南部、中部局部海域成为优势种。本次调查结果与以往资料比较，硅藻优势类群发生明显变化，甲藻种类数和数量增多，浮游植物数量明显增加，但水平分布变化不大。