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本项目通过搜集四川、青海、甘肃、宁夏等省区的岩羊组织样品和DNA数据，对岩羊四川亚种的遗传结构及其与矮岩羊的系统发生关系进行了研究。本研究发现宁夏贺兰山的岩羊种群已经与四川、青海、甘肃的岩羊发生了显著的遗传分化，根据亚种分类的75％原则，贺兰山岩羊有可能已进化为岩羊指名亚种和四川亚种之外的一个新的独立亚种;另外还发现目前唯一能够确定的矮岩羊分布区四川省巴塘县的矮岩羊并不是一个单系群，在系统发生树上与岩羊交错分布，矮岩羊与岩羊的平均遗传距离远小于牛科动物的种间差异，因此断定矮岩羊只是一些发生了显著的形态变异的四川岩羊个体，而不是一个独立的种或亚种。