【摘 要】
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本研究对已公布的鹌鹁核酸序列和EST序列总计635条序列中1～6核苷酸重复SSR的分布进行了分析。结果表明,其中共发现120条SSR,检出率为18.9%。二核苷酸重复基元的SSR占40.0%,三
【机 构】
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河南科技大学动物科技学院,471003
【出 处】
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中国畜牧兽医学会信息技术分会2009年学术研讨会
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本研究对已公布的鹌鹁核酸序列和EST序列总计635条序列中1～6核苷酸重复SSR的分布进行了分析。结果表明,其中共发现120条SSR,检出率为18.9%。二核苷酸重复基元的SSR占40.0%,三核苷酸重复基元的SSR占35.8%,五核苷酸重复基元和四核苷酸重复基元的SSR类型,分别占14.2%和10.0%,没有发现六核苷酸重复基元的SSR。组成这些SSR的主要基序有AT/TA,CA/GT,GA/CT,CAG/GTC,AGG/TCC,TAA/AAT,GGC/CGG,GAC/CTG,CGA/GCT,GCA/CGT,GAG/CTC,ACC/CCA,TCTT,TTTG,TCCA,ATGAT/ATCAT,TCCCT,TTCCC。并且SSR的重复次数都在5以上,由此可以推测利用鹌鹑核苷酸序列和EST序列中的SSR序列将有可能开发一批有价值的SSR分子标记供各种研究所用,还有助于鹌鹑高密度遗传图谱的构建、重要功能基因克隆及基因功能等研究。
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