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【研究目的】明确云南咖啡锈菌生理小种类型,为咖啡锈病防控及抗锈病育种提供科学依据;【方法】于2011~2015年间在云南芒市、泸水县、隆阳区、等12个县(市)的生产品种上采集咖啡锈病标样51份,采用温室接种的方法对19个鉴别品种接种咖啡锈菌,调查各鉴别品种的发病程度;【结果】鉴定出9个生理小种,分别为VIII(v2,3,5)、XXXIII(v5,7orv5,7,9)、XXXIV(v2,5,7or v2,5,7,9)、XXXVII(v2,5,6,7,9)、XLI(v2,5,8)、XLII(v2,5,7,8orv2,5,7,8,9)、New race (v2,5,6,7 or v2,5,6,7,9)、New race (v1,2,5,7 or v1,2,5,7,9)、New race (v1,5,7orv1,5,7,9)。XXXIV为优势小种,占测试样本的54.91%,XXXIII、XXXVII、VIII、XLI分别占测试样本的15.68%、11.76%、5.88%和3.93%,XLII、New race(v2,5,6,7 or v2,5,6,7,9)、New race (v1,2,5,7 or v1,2,5,7,9)、New race (v1,5,7 or v1,5,7,9)各种1.96%,VIII号生理小种寄主品种为S.288、XXXVII号生理小种寄主品种为CatimorT5175、其他生理小种寄主品种均为Catimor7963;【结论】XXXIII、XXXIV、XLI、XLII、New race (v2,5,6,7 or v2,5,6,7,9)、New race (v1,2,5,7 or v1,2,5,7,9)、New race (v1,5,7 or v1,5,7,9)等新小种的产生,使云南主栽品种Catimor7963丧失了抗锈性,标志着云南咖啡锈菌群体结构发生了变异,应引起育种和推广部门的高度重视。