随着人类文明的发展,人类也越来越关注自身的健康和野生动物的多样性,因此本文对国内外13年来基于mtDNA序列鉴定动物物种的方法进行了文献综述,对鉴定方法的发展历程进行了简述,并且对各种鉴定方法的使用情况和优缺点进行了分析,以期找到一种更理想的鉴定方法. 任何一个良好的分子生物学检测方法应该满足以下4个条件:通用性、特异性、灵敏性和稳定性。因此为了更好地鉴定动物物种，建议使用D-loop区序列作为分子标记，原因是:①D-loop区在所有的线粒体基因中碱基替换率最高，平均碱基替换速率是线粒体其他序列的5倍，同时也是线粒体基因组中进化速度最快的区域;②GenBank中含有丰富的D-loop区序列数据，且许多亚种的D-loop区序列也不断地进入GenBank中;③D-loop区的长度多态性是脊椎动物线粒体基因组长度多态性的最主要原因;④有些物种没有mtDNA的全序列，但均有D-loop结构区段的序列，而在高等植物中没有发现类似D-loop结构的基因。 因此，建议使用D-loop区的物种特异性PCR鉴定动物物种。此外，物种特异性PCR与多重PCR的联合使用将会更有前景，因为多重PCR通过一步PCR过程就能同时鉴定几种动物物种。 虽然这些基于PCR的方法有很多优点，但PCR技术仍普遍存在很多缺点。①PCR技术没有组织特异性，例如不能直接反映不同物种或不同区域鹿角的药理学活性;鹿茸从角尖部到中下部有蜡片、血片和骨片的质量等级之分，这些等级是PCR鉴别所不能区分的;不能区分是被禁止的反当动物原料还是其他可允许的反当动物原料例如奶制品。②食品中的添加剂可能抑制DNA聚合酶的活性，也应该作为扩增失败的主要原因。因此在使用这些分子方法时，也不应排斥传统方法，如形态观察、显微镜技术、蛋白质分析技术等。