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目的 探索通过成本核算制定医保的病种支付标准，分析该支付标准对公立医院的补偿和运行机制产生的影响。方法 采用回顾性调查收集成都市三甲医院胆囊炎伴胆结石的费用、成本和医保报销比例等数据，以此设定医保的病种支付价格。结果 制定统一的支付价格将使部分医院收入和结余率下降，将促使医院更为关注戚本，对运行机制进行调整。结论 利用科室成本核算为基础制定病种的支付标准具有可操作性，有利于公立医院的补偿与运行机制改革。